云南省瑞丽市2016年登革病毒包膜蛋白基因进化特征分析
摘要:
为阐明云南省德宏州瑞丽市2016年登革病毒(Dengue virus,DENV)流行株包膜蛋白(Envelope protein,E)基因进化特征及其血清型、基因型和流行病学特点.采集登革热患者急性期血清标本,用RT-PCR法检测DENV核酸,用C6/36细胞培养法分离病毒,并进行DENV C/PrM和E基因核苷酸序列测定,用MEGA6.0软件邻接法(Neighbor-Joining)进行E基因系统进化分析.结果从瑞丽市2016年登革热患者血清中分离到25株DENV(本地感染病例15株和缅甸输入性病例10株),并获得这25株病毒的E基因核苷酸序列,系统进化分析表明,14株为DENV血清型1型(DENV-1)的基因Ⅰ型,2株为DENV-2亚洲基因Ⅰ型,5株为DENV 3基因1型,4株为DENV 4基因Ⅰ型.这些新分离株与2013~2015年瑞丽市(11 DENV-1、4 DENV-2和2 DENV-4)和临沧市(2 DENV-1)相同血清型DENV代表株的基因型和进化群相一致,而与西双版纳州2013年DENV-3基因Ⅱ型和2015年DENV-2全球基因型不同.所有瑞丽市DENV流行株均与缅甸等东南亚国家流行株具有较近的亲缘关系.这4种血清型DENV广泛分布于中缅两侧边境地区.本研究证实,2016年我国瑞丽市存在着4种血清型DENV的流行,其中DENV-1、DENV-2和DENV-4与2013~2015年瑞丽市同血清型流行株的基因型及其进化群相同,DENV-3为2016年首次出现本地流行.所有血清型病毒的传播来源均为缅甸北部边境地区,应加强中缅两侧边境地区登革热联防联控工作.
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doi:
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关键词:
登革病毒(DENV)
包膜蛋白
基因
系统进化分析
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Keyword:
Dengue virus(DENV)
Envelope protein
Gene
Phylogenetic analyses
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作者:
胡挺松
刘永华
张海林
尹小雄
李萍
杨召兰
余静
张富强
范泉水
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Author:
HU Tingsong
LIU Yonghua
ZHANG Hailin
YIN Xiaoxiong
LI Ping
YANG Zhaolan
YU Jing
ZHANG Fuqiang
FAN Quanshui
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作者单位:
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刊名:
病毒学报
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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