生物信息学方法分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控
摘要:
目的 研制生物信息学软件,分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控.方法 采用java语言编制能够从NCBI的高通测序数据库中比对特定序列的软件工具,利用该软件进行统计分析DDIT3的表达丰度、染色质活化程度及其受miRNA调控程度.结果 开发软件工具无需安装且操作简单.成骨细胞中DDIT3的转录变体丰度不同,在染色质活化程度较低,且受miRNA调控程度也较低.结论 本文开发的软件工具适用于从NCBI的SAR全基因高通测序数据库中研究个别基因的转录调控.
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doi:
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关键词:
生物信息学
高通测序
DDIT3
转录与调控
成骨细胞
内质网应激
组织构建
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Keyword:
Bioinformatics
High - throughput sequencing
DDIT3
Transcription and Regulation
Osteoblasts
ER stress
Tissue construction
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作者:
王遗伟
张蕴显
周萍
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Author:
Wang Yiwei
Zhang Yunxian
Zhou Ping
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作者单位:
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刊名:
中华生物医学工程杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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