生物信息学方法分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控

摘要:

目的 研制生物信息学软件,分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控.方法 采用java语言编制能够从NCBI的高通测序数据库中比对特定序列的软件工具,利用该软件进行统计分析DDIT3的表达丰度、染色质活化程度及其受miRNA调控程度.结果 开发软件工具无需安装且操作简单.成骨细胞中DDIT3的转录变体丰度不同,在染色质活化程度较低,且受miRNA调控程度也较低.结论 本文开发的软件工具适用于从NCBI的SAR全基因高通测序数据库中研究个别基因的转录调控.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 生物信息学 高通测序 DDIT3 转录与调控 成骨细胞 内质网应激 组织构建
  • Keyword: Bioinformatics High - throughput sequencing DDIT3 Transcription and Regulation Osteoblasts ER stress Tissue construction
  • 作者: 王遗伟 张蕴显 周萍
  • Author: Wang Yiwei Zhang Yunxian Zhou Ping
  • 作者单位:
  • 刊名: 中华生物医学工程杂志
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